[发明专利]IGF-1基因启动子区微卫星多态性的检测试剂盒无效

专利信息
申请号: 201410439642.1 申请日: 2014-09-01
公开(公告)号: CN104164432A 公开(公告)日: 2014-11-26
发明(设计)人: 刘蕊;胡丽玲;吴萍;赵立杰;许丹丹 申请(专利权)人: 天津市人民医院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 天津佳盟知识产权代理有限公司 12002 代理人: 侯力
地址: 300121 *** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: igf 基因 启动 子区 卫星 多态性 检测 试剂盒
【说明书】:

技术领域

 本发明涉及一种IGF-1基因启动子区微卫星多态性的检测试剂盒。本试剂盒能对IGF-1基因启动子区微卫星既(CA)重复序列多态性进行检测,尤其可以检测出(CA)重复次数为(19)和(CA)重复次数为非19,以及(CA)重复次数为19的纯合子和杂合子。可以用于糖尿病患者伴随结直肠癌发生的辅助诊断,糖尿病患者临床用药的评估等研究领域。

背景技术

结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)作为最常见的消化道肿瘤之一,在癌症发病率中所占比例高达9%,发病率和死亡率分别居所有癌症的第三位和第四位。其很多研究者也将目光锁定在其研究机制上,流行病学研究发现,糖尿病(Diabetes mellitus,DM)与包括结直肠癌在内的多种恶性肿瘤的发病密切相关。且长期接受胰岛素治疗患者该病发生的危险性增加2-3倍。

关于DM患者伴CRC发生风险增加的机制,有人提出了胰岛素-胰岛素样生长因子(IGF)轴学说,即血清异常增高的胰岛素水平可通过胰岛素-IGF-1轴促进结直肠上皮细胞增殖转化、抑制细胞凋亡导致CRC的发生。而大量研究报道,“高胰岛素血症”及高浓度的IGF-l会增加CRC的发生风险,有meta分析表明IGF-1浓度与大肠癌的发生风险正相关,总OR=1.56 ( 95%CI:1.14-2.13),血清高水平IGF-1 是大肠癌的独立危险因子。

国外研究报道表明血清IGF-1水平与IGF-1基因启动子CA重复序列有关,IGF-1基因启动子上游约1kb处一段含有11-23个CA重复的多态性微卫星片段,其中19次CA重复的等位基因频率最高,被认为是野生型等位基因。携带(CA)19/19的IGF-1浓度低于其杂合子基因型及其它基因型,所以CA重复次数与IGF-1的浓度相关。有学说认为高胰岛素血症可以通过胰岛素-IGF-1轴促进结直肠上皮细胞增殖转化、抑制细胞凋亡导致CRC的发生,所以非携带(CA)19/19的基因型可能是易受胰岛素影响而导致结直肠癌发生的高危基因型。既携带非(CA)19/19的基因型的糖尿病患伴结直肠癌发生的风险会明显,该基因型可能是易于发生结直肠癌的胰岛素敏感基因型,所以在临床上明确糖尿病患者IGF-1基因启动子(CA)重复序列多态性,确定其基因型,可以对携带胰岛素敏感基因型的糖尿病患者在使用胰岛素上进行评估,为其提供个性化的治疗方案,降低该类糖尿病患者伴结直肠癌发生的风险。所以(CA)重复序列多态性的检测对于避免糖尿病患者伴结直肠癌发生至关重要。

关于(CA)重复序列多态性的检测方法,目前较常用的方法是测序的方法,但是该方法的价格比较昂贵,不适合医院广泛开展,因此必须寻找一种应用简单、结果可靠、

价格低廉的,且适合临床开展的技术来开发IGF-1基因启动子区 (CA)重复序列多态性检测试剂盒以解决上述问题。

发明内容

本发明的目的在于提供一种检测IGF-1基因启动子区 (CA)重复序列多态性的试剂盒,以便筛查出糖尿病受试者的基因型是否是易受胰岛素刺激而诱发结直肠癌的高危基因型,可以用于糖尿病患者伴随结直肠癌发生的早期辅助诊断,以及糖尿病患者临床使用药的评估等研究领域。

我们经过与测序等方法的对比评估,选择了PCR-单核苷酸构象多态性技术。

PCR-单核苷酸构象多态性技术是一种直接检测基因突变的分子生物学技术,具有灵敏度高,特异性好,简便,廉价等优点。本发明采用PCR技术,根据单链DNA构象差别,即长度不同或单个核苷酸不同的单链DNA片段空间构象不同,当其在非变性聚丙烯酰胺凝胶中进行电泳时,电泳的位置会不同,根据电泳DNA marker分析不同受试者的基因型。本发明涉及的试剂盒可以广泛用于糖尿病患者(CA)重复序列多态性检测,提高检测的可重复性和准确性,更准确的筛查出易受方案,可以大大地降低医疗成本和费用,减少医疗资源的浪费,对部分患者胰岛素使用进行评估,为其提供个性化的治疗方案,降低其结直肠癌发病风险,提高患者生存质量。

本发明在对GENBANK 上所有已知的IGF-1启动子核酸序列进行比对的基础上,最后选定GENBANK数据库的序列NC_012920为模板设计引物,该引物在含有耐热DNA 聚合酶、高质量的脱氧糖核苷三磷酸(dNTPs) 以及Mg2+ 等的PCR 反应缓冲液中能实现体外扩增出特异性强含 (CA)重复序列大小为150bp左右的扩增产物,扩增物的特异性和准确度经琼脂糖凝胶电泳验证后,将在非变性的聚丙烯酰胺凝胶通过电泳条带位置和数目实现对 (CA)重复序列多态性的检测。

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