[发明专利]霍山石斛微卫星DNA分子标记

摘要

本发明公开了一种霍山石斛微卫星DNA分子标记，包括霍山石斛微卫星(CT)n富集文库的构建，微卫星序列阳性克隆的筛选及测序，得到36个含有微卫星重复序列的克隆，筛选得到了12个高多态性的微卫星分子标记Hs1、Hs2、Hs3、Hs4、Hs5、Hs6、Hs7、Hs8、Hs9、Hs10、Hs11、Hs12。本发明可用于研究霍山石斛的遗传多样性，石斛属植物种间和居群间的变异和进化关系，具有重复性好，是一种可靠有效的分子标记。

主权项

一种霍山石斛微卫星DNA分子标记，其特征在于：所述微卫星标记的标号分别为：Hs1、Hs2、Hs3、Hs4、Hs5、Hs6、Hs7、Hs8、Hs9、Hs10、Hs11、Hs12；其核苷酸序列分别为：Hs1：gatcaattga ggtggcaagt tcggataatt aggaatatgg ccttcaacct ccttattagt     60ggaagccacg accttaagaa caaagctaag atgcttcaat gaaagagata aggaaccctt    120caagcgtaaa aattaacatt tcaaagctct gaattttacc tgctcgctgt ggccctgtgg    180aaagtagaca acacgggttc cgacattggg cagacacact agaggaccag cacaagcatg    240ccaaagctcg gagttcaagc atctcttgtc ccccccttcc ataatgtcca cgagaccata    300aatatcaaaa caactatata caatagagag agtgcgaaat agagatagag agagagatag    360agagagagag agagagagag agagagagag agagagagag aaccttcctc atcctgctga    420ccagaactcc aaccgtcgag agcttcatcg cagcactcta aaaagctccg taaacactca    480acaagtaaga gaaacctaca gggcacatat ccaacttcac cgcgtt                   526Hs2：gatcaaaatg ttgtaacttc cgaacccgca ggaagggaac gtcgccgaac gaacgaagcc     60gaccagcatg aagaagctga agaagctagg aggcgacggg ataatggagg aaagattgtt    120gcctctccct ctccctctcc ctatccctct ccccccctct ctctctctct ctctctctct    180ctctctctct ctctctctct ctctctctct gaacgaagga atcaggaggt agaggtggag    240ttcggacgag gttacgtgga tggtcggcct gatgtggctt cggtctaggt aaggttatgg    300cgtgttaagt tcgagcttta gggttctagc gtcggcttga gaagatggag gtcggaaggt    360ttgcggctgg ttggagacga atcggaacta gggcagagga ttcgaagggg tgatcggcag    420tggcttgaag tcgagagcgg gagagagtcg tcgcgaatgg aggtctcttc atctcctatt    480taacgacgcg aaaagtacga ttcagcggaa ctcttgcagg aataaccagc ggcgccgaac    540agtcaggtaa cgggatttat gggatttttg tttagcgttt ttttctctct ttttgttctt    600ttaaacatag gtcaacaaga actctggctt agatggcatt cggaccagcg gcgtccgtag    660gctgccggct gaaattccag agtggtggta gaggaggttt ttattttctt ccttattttc    720ttctgttcct gctt                                                      734Hs3：gatctagttc tccttttaaa tatccctatt ctacccacat ttgtttagct gggttggtgg     60acagagtatg gttaggaact ctcaactcat gctcgattcc tcttaagtgg gctccaatca    120aatgcacgtc agaaagtttc tggggtgggt gccgcttcta agtcagtcga gaattagtca    180ctacattaag cgtcctttcg gggatgacaa cgaatgaata cccagtttcc aaaaataaaa    240aaatccctat tatacaattt ataccttcct caaagcaaga gtgaaccagt tttctgtgtt    300ctgaacccat cattttatgt tttcttcact tatatctaaa ggagagagag agagagagag    360agagagagag agagagagag agagagagag agagagagag agagattctc tatggcaaaa    420atggcaggaa gtaacaacag gaagaggcca tatgggttgc ttctgctgct tgctcttggc    480atggcagtta tgtgcgcagt ggtgcttcac cagcttaggg agggcagagt tcttagcctc    540ctaatccagg aaagagacca gcagcttgac acccttcaaa tcctcttgca ggttctgaat    600aagcttttca ttattttttc taactattta agccttcttt tatcatattc gatgcaaatt    660catcaaaata gatttttttt taatgcctca accaatttta gttgggatg                709Hs4：gatcatcaac gacaagccat caaatagaat gtgattggtg atgaatgact tttgtgctag     60gtcgctggac ttggtggaga ggtgtcgacg atgtttgtat gttggtggct aggaagttga    120agtgaggtgg ctgctggtta aggtcaatag tgagcaacgg tttgagagag agagagagag    180agagagagag agagagagag agagagagct cagtggtggt aatgaagtga gtgagaaggg    240aagtgagatt catcggcaaa gagtttgatt agttgagagt ggcggcctga gataagttag    300tgtggatagt tcatcattgg agaaggtgca tatggttggc acttggcagt taacttaatg    360agacagagaa gtgcagagga aggagtcata atcaaaagga gaggattaaa atcctctact    420ccacatgaat ggttttgttg atgctgtcat cagcaagctt ttgctatgcc ttcttgcctc    480tctatcatct agggttttaa tagtttaggc aaaagcgaaa ggggaaaggt               530Hs5：gatcatgcac tatgttccta cgccatggat gatgcgctct gttacaacac cattgatgac     60gcgttctgtt cctacgccac ggatgatgcg ctctatccat acgccacaaa gaatgcgctc    120tgtttcgaat ccctctcatc gtcgccgtta cggtgtgcac atcgtttctt ttcttctctt    180aatttctaca ttctctctct ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctctcaca    240cacacacaca cacacattcc cactttttgt gctcattttt tcgattaacg attcagagta    300tgaagtacta tctcgtttgc cctcacaaca tacaaatcat ataagggtgc agtctgcagc    360cattgatact aatgagatgg aaccagagca acaggtaatt aatcttaaga acgatcatga    420ttttttacat acgagt                                                    436Hs6：gaacatcctg ctgacagaag cggacagaac aaagcccgct ctgcccctac tcgacaaagc     60gctatcttcc aaattccagc aagaagaatg tcttcccagt tcctcctcct ataaaaccct    120ccccatttct ctgcccatta cgaaactaaa tcctccaaaa aatctctctc tctctctctc    180tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctctctctc tcgtccttcc tacttgtgct    240ttaaaagtta acagaactaa cagtaaccat gtgtcaatca aataatccag agaccaactt    300caaagacagc catccccata cagacgcaga cgcagtcttc gctgcaccac ttatcgccaa    360gacccagagc aacgatgaaa cccccaacat caaatcccca ccgccggcgc ctgctcgcca    420gcttgcgagg tccttcatcg aaataaaatc aattttttcc atatcacttc ccatgattct    480gaccggcctt ctcctctact cccgctctat                                     510Hs7：gatcatactg gatttatagt ggttcgttca aaagtgacta tccttttgct cccacaataa     60ggtagagaag ccctcacaaa aactccttta tgccaacccc gatgaggtag agaacccaac    120tccttttgct tcctcctgaa gaagacagag aacccaaatc tttttgcttt ctcctgaagc    180aggcagagaa ccttgaccaa ttactgaagc ttatctccct tgaaccccta aggacaaagg    240acgaagactg gagaaaatgc catggaacct tgcttggagc aacctttgtg aatccctctc    300acaaactccc tctcacaagt tcctccttct ctctccctct ctctctttct cctcttggct    360ctctcaggtt aagacaacag ctaaagttct ctttgcatga gaaaattcgg gtcctttaaa    420tataatttca agaaccgaca ttatcattca ggatgatagg aatatc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