[发明专利]用减少数量的转录物测量进行的基因表达概况分析

摘要

本发明提供用于制备和使用全转录物组基因表达概况分析平台的组合物和方法，所述平台仅测量转录物总数的选定亚组的表达水平。因为据信基因表达是高度相关的，所以少数(例如1,000个)适当选择的转录物的直接测量允许推断转录物的表达水平。因此，相对于需要测量所有转录物的众所周知的常规方法而言，本发明具有降低全转录物组基因表达概况分析的成本和增加其通量的潜力。

主权项

一种使用亚转录物组数量的转录物测量来制备全转录物组mRNA表达概况分析平台的方法，所述方法包括：a) 提供：i) 来自第一生物样品集合的全转录物组mRNA表达数据的第一文库；ii) 第二生物样品集合；iii) 来自所述第二生物样品集合的全转录物组mRNA表达数据的第二文库；iv) 能测量转录物表达水平的装置；b) 对所述第一文库进行计算分析，使得建立多个转录物聚类，其中所述聚类的数量实质上小于所有转录物的总数；c) 在所述多个转录物聚类的每一个内鉴定形心转录物，由此建立多个形心转录物，所述剩余转录物为非形心转录物；d) 用所述装置测量来自所述第二生物样品集合的至少一部分转录物的表达水平，其中所述部分的转录物包括经鉴定为来自所述第一文库的所述形心转录物的转录物；e) 确定所述形心转录物表达水平的所述测量用以推断来自所述第二文库的至少一部分转录物的水平的能力，其中所述部分由非形心转录物组成；f) 选择其所述表达水平具有推断所述部分的非形心转录物水平的所述能力的所述形心转录物。