[发明专利]用于基于规则的基因组设计的方法在审
| 申请号： | 201780049973.6 | 申请日： | 2017-06-15 |
| 公开（公告）号： | CN109997192A | 公开（公告）日： | 2019-07-09 |
| 发明（设计）人： | G·库兹耐特索夫;M·J·拉乔伊;M·M·兰登;M·G·纳波利塔诺;D·B·古德曼;C·J·格雷格;G·M·丘奇;N·奥斯特罗夫 | 申请（专利权）人： | 哈佛学院董事及会员团体 |
| 主分类号： | G16B20/50 | 分类号： | G16B20/50;C12N15/10;C12N15/09;C12Q1/686 |
| 代理公司： | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人： | 陈扬扬;陶家蓉 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本文描述了用于设计、测试和验证基因组设计的方法和系统。计算机实施的方法包括，接收已知基因组和等位基因列表的数据，鉴定和去除已知基因组中各等位基因的出现，确定用于替换已知基因组中出现的多个等位基因选择，基于已知基因组产生基因组设计的多个替代性基因序列，通过为各替代性基因序列中各规则或约束或条件或参数或特征分配评分，将多个规则或约束或条件或参数或特征应用于各替代性基因序列，产生评分，基于评分的加权组合，对各替代性基因序列进行评分，并基于评分选择至少一个替代性基因序列作为基因组设计。 | ||
| 搜索关键词： | 基因组 基因序列 替代性 等位基因 测试和验证 计算机实施 加权组合 特征分配 特征应用 去除 替换 | ||
【主权项】：
1.一种由计算平台实施的用于设计基因组的方法，所述方法包括：接收已知基因组和所述已知基因组中待替换的等位基因列表的数据作为计算平台的输入；基于等位基因列表，通过所述计算平台鉴定所述已知基因组中各等位基因的出现；通过所述计算平台，由所述已知基因组去除所述各等位基因的出现；通过所述计算平台，确定多个等位基因选择，用于替换所述已知基因组中各等位基因的出现；通过所述计算平台，基于已知基因组产生基因组设计的多个替代性基因序列，其中，各替代性基因序列包含来自多个等位基因选择的不同等位基因选择；通过所述计算平台，通过为各替代性基因序列中各规则或约束或条件或参数或特征分配评分，将多个规则或约束或条件或参数或特征应用于各替代性基因序列，产生应用于各替代性基因序列的多个规则或约束或条件或参数或特征的评分；通过所述计算平台，基于多个规则或约束或条件或参数或特征的评分的加权组合，对各替代性基因序列进行评分；通过所述计算平台，基于加权的评分，选择至少一个替代性基因序列作为基因组设计。
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