[发明专利]基于残基坐标系的距离信息引导折叠蛋白质结构预测方法

摘要

一种基于残基坐标系的距离信息引导折叠的蛋白质结构预测方法，首先，根据需要预测蛋白质结构的序列信息从AlphaFold2服务器获取蛋白质的主干局部信息；然后，根据预测的序列信息从从ROBETTA在线服务器上得到3片段和9片段的片段库文件；接着，以每个残基的Cα原子为原点构建逐残基坐标系，计算相对于每个残基i下的预测的原子坐标，然后将预测的残基原子坐标与AlphaFold预测的残基原子坐标进行比较求距离均值，在Rosetta基础上使用小生镜多模态算法框架，加入插件SNfold，结合形成一种多模态的搜索蛋白质构象空间的方法，执行迭代，直到次数结束，搜索出5个模型为止。本发明采样效率高、预测精度高。