[发明专利]一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法

摘要

本发明公开了一种基于超图随机游走的scSPRITE数据补全方法，包括以下步骤：S1，获取scSPRITE测序文档；S2，提取scSPRITE测序文档中的基因位点，并得到超边集合和超图节点集合；S3，计算每个超图的超边集合中每个超边的度以及超图节点集合中每个节点的度；S4，确定每个节点转移到下一节点的游走转移概率，获得每个超图的节点向量；S5，将每个超图的节点向量输入到Node2Vec模型中进行训练，输出每个超图的节点嵌入向量；S6，计算每个超图中每两个节点嵌入向量的相似度并筛选生成每个单细胞的交互矩阵。本发明的单细胞三维基因组结构补全方法能够定义少量群细胞的三维基因组结构，通过少量群细胞即可准确测序得到单细胞基因组结构，降低了测序工作的工作量，提高了测序效率。