[发明专利]用于基于微滴的单细胞条形编码的方法和系统在审
| 申请号： | 201880008233.2 | 申请日： | 2018-01-30 |
| 公开（公告）号： | CN110214186A | 公开（公告）日： | 2019-09-06 |
| 发明（设计）人： | 卡米拉·贝尔霍钦;拉吉夫·巴拉德瓦杰;克里斯多佛·辛德森;迈克尔·史诺-莱文;比尔·林;安东尼·马卡若维茨;普拉纳夫·帕特尔;凯瑟琳·法伊弗;安德鲁·D·普莱斯;穆罕默德·拉希米伦吉;托拜厄斯·丹尼尔·惠勒;尹沂峰 | 申请（专利权）人： | 10X基因组学有限公司 |
| 主分类号： | C12N15/09 | 分类号： | C12N15/09;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人： | 贺淑东 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 扩增 样品制备技术 条形码 细胞珠 珠粒 分区 病毒 生物化学 单独细胞 单个操作 可能目标 全基因组 生物颗粒 条形编码 细胞核酸 不混溶 逆转录 凝胶珠 试剂盒 小群体 测序 微滴 集合 细胞 配置 加工 分析 | ||
1.一种用于加工或分析来自细胞的一种或多种组分的方法，所述方法包括：
(a)提供多个细胞珠粒和多个条形码珠粒，其中(i)所述多个细胞珠粒的细胞珠粒包含所述细胞的所述一种或多种组分，所述一种或多种组分包含核酸分子，并且(ii)所述多个条形码珠粒的条形码珠粒包含多个核酸条形码分子以用于对所述核酸分子进行条形编码；以及
(b)将所述多个细胞珠粒和所述多个条形码珠粒分配到多个分区中，其中在分配后，所述多个分区的分区包含所述细胞珠粒和所述条形码珠粒。
2.如权利要求1所述的方法，其还包括对所述核酸分子进行一种或多种反应。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述一种或多种反应包括核酸修饰、核酸扩增、核酸插入、核酸裂解、逆转录或其任何组合。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述核酸修饰包括连接、消化、甲基化、随机诱变、亚硫酸氢盐转化、尿嘧啶水解、核酸修复、加帽、脱帽或其任何组合。
5.如权利要求3所述的方法，其中所述核酸扩增包括等温扩增或聚合酶链式反应。
6.如权利要求3所述的方法，其中所述核酸插入包括转座子介导的插入、CRISPR/Cas9介导的插入或其任何组合。
7.如权利要求3所述的方法，其中所述核酸裂解包括转座子介导的裂解、CRISPR/Cas9介导的裂解或其任何组合。
8.如权利要求2所述的方法，其中所述一种或多种反应在所述分区中进行。
9.如权利要求2所述的方法，其中所述一种或多种反应在所述分区外进行。
10.如权利要求2所述的方法，其中所述一种或多种反应在(a)之前进行。
11.如权利要求2所述的方法，其中所述一种或多种反应在(a)之后进行。
12.如权利要求1所述的方法，其还包括使用所述多个核酸条形码分子来由所述核酸分子产生带条形码的核酸分子。
13.如权利要求12所述的方法，其中产生所述带条形码的核酸分子包括核酸扩增。
14.如权利要求12所述的方法，其中产生所述带条形码的核酸分子包括连接。
15.如权利要求12所述的方法，其还包括从所述分区释放所述带条形码的核酸分子或其衍生物。
16.如权利要求12-15中任一项所述的方法，其还包括对所述带条形码的核酸分子或其衍生物进行测序。
17.如权利要求16所述的方法，其还包括在所述测序之前，使所述带条形码的核酸分子或其衍生物进行核酸扩增。
18.如权利要求17所述的方法，其中所述核酸扩增是等温扩增或聚合酶链式反应。
19.如权利要求18所述的方法，其中所述聚合酶链式反应是数字聚合酶链式反应。
20.如权利要求1所述的方法，其中所述细胞珠粒包含所述细胞，并且使包含所述细胞的所述细胞珠粒经受足以裂解所述细胞以产生所述一种或多种组分的条件。
21.如权利要求20所述的方法，其中使所述细胞珠粒经受所述足以裂解所述分区中的所述细胞的条件。
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