[发明专利]一种确定婴幼儿肠道菌群成熟度的方法和标志物组合

摘要

本申请公开了一种确定婴幼儿肠道菌群成熟度的方法和标志物组合。本申请的方法，包括以提取自待测婴幼儿离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析，将标志物组合的定量分析结果，与基线参考标准相比较，确定肠道菌群的相对成熟度；标志物组合包括：X个分类学单元、Y个代谢通路、和/或Z个基因基线参考标准是以提取自标准婴幼儿个体的离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析的结果；标准婴幼儿个体符合(a)人体测量指标符合WHO儿童生长标准的正常范围；(b)顺产出生、断奶前为母乳喂养、采样前无抗生素暴露。本申请的方法可提高确定婴儿肠道菌群成熟度的准确性、精确性和稳健性。

主权项

1.一种确定婴幼儿肠道菌群成熟度的方法，其特征在于：包括以提取自待测婴幼儿离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析，将标志物组合的定量分析结果，与基线参考标准相比较，确定肠道菌群的相对成熟度；其中，所述标志物组合包括：X个分类学单元、Y个代谢通路、和/或Z个基因；所述X个分类学单元是指：分类学单元1、分类学单元2、……、分类学单元X；所述Y个代谢通路是指：代谢通路1、代谢通路2、……、代谢通路Y；所述Z个基因是指：基因1、基因2、……、基因Z；X为≥0的整数，Y为≥0的整数，Z为≥0的整数；所述基线参考标准是以提取自标准婴幼儿个体的离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析的结果；所述标准婴幼儿个体符合以下两个条件(a)人体测量指标符合WHO儿童生长标准的正常范围，或生理指标符合实验动物临床生理指标正常范围；(b)顺产出生、断奶前为母乳喂养、采样前无抗生素暴露；所述采样前无抗生素暴露是指母亲在孕期和哺乳期未使用抗生素，或者婴幼儿出生后至采样前未使用抗生素，又或者至少在采样前一周未使用抗生素。