[发明专利]一种基于深度神经网络的点交互式医学图像分割方法在审

专利信息
申请号: 201910374698.6 申请日: 2019-05-06
公开(公告)号: CN110415253A 公开(公告)日: 2019-11-05
发明(设计)人: 孙晋权;史颖欢;高阳 申请(专利权)人: 南京大学;江苏万维艾斯网络智能产业创新中心有限公司
主分类号: G06T7/11 分类号: G06T7/11;G06T7/00
代理公司: 南京泰普专利代理事务所(普通合伙) 32360 代理人: 窦贤宇
地址: 210023 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明是专门针对医学图像中的肾肿瘤分割问题而提出的一种点交互的深度学习分割算法。该算法由点交互预处理模块,双向ConvRNN单元、核心深度分割网络组成。该算法从专家提供的肿瘤中心位置出发,在间隔均匀的16个方向上,由内向外按4像素步长,密集采集16个大小为32×32的图像块,形成图像块序列,并使用具有序列学习的深度分割网络学习目标内外变化趋势,确定目标边缘,实现对肾肿瘤的分割。该方法能够克服医学图像对比度低、目标位置多变、目标边缘模糊的影响,适用于器官分割和肿瘤分割任务。相比当前已有技术,该方法具有如下特点:1)交互方式简洁方便;2)提出了Sequential Patch Learning概念,使用序列图像块捕捉长程语义关系,即使较浅的网络也可以获得较大的感受野;3)提出了全新的ConvRNN单元,学习目标内外变化趋势,具有较强的可解释性,符合医生的实际工作方式,最终模型精度高,适用性强。
搜索关键词: 分割 变化趋势 目标边缘 医学图像 肾肿瘤 图像块 算法 医学图像分割 预处理模块 分割算法 间隔均匀 交互方式 目标位置 器官分割 神经网络 网络学习 网络组成 序列图像 学习目标 由内向外 语义关系 肿瘤分割 最终模型 解释性 长程 像素 肿瘤 捕捉 采集 模糊 学习 医生 网络
【主权项】:
1.点交互式的深度学习肾肿瘤分割方法,包括如下步骤:(1)选取三维肾肿瘤CT数据集,并划分训练集和测试集;(2)对肾肿瘤CT数据做重采样,使得每份三维数据的体素空间系数0.625×0.625×1mm;将重采样后的图像,按照Z轴方向取二维图像;(3)点交互:对于每张图像,由医生判断当前图像是否包含肾肿瘤,如果包含,医生在肾肿瘤的大致中心点点,以此指示肿瘤的大致位置;(4)以给定的肿瘤中心为起点,在16个间隔相同的方向上,按4个像素为步长,采集一系列图像块,每个方向上的所有图像块,按照由内到外的顺序组成图像块序列,每个图像块序列视为后续模型的一个输入样本;(5)在深度学习框架Pytorch中构建用于学习图像块序列中内外变化趋势的双向ConvRNN单元;(6)基于双向ConvRNN单元,在深度学习框架中进一步构建完整的肾肿瘤分割深度网络;(7)基于训练数据集上采集的图像块序列,训练肾肿瘤分割深度网络,待模型收敛后保存模型参数;(8)用训练好的深度网络在测试数据集上进行肾肿瘤分割,并将最终的分割结果整合成最终的分割结果。
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说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

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