[发明专利]大肠癌标志物及其应用有效
| 申请号： | 201510640722.8 | 申请日： | 2015-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN105296590B | 公开（公告）日： | 2019-04-19 |
| 发明（设计）人： | 仲文迪;张林爽;郑智俊 | 申请（专利权）人： | 上海锐翌生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/04 | 分类号： | C12Q1/04;C12Q1/6886;C12M1/34;C12R1/145;C12R1/01 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 李志东 |
| 地址： | 200050 上海市长宁*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 肠癌 标志 及其 应用 | ||
【说明书】：
本发明公开了一种大肠癌标志物，包括以下微生物中的至少两种：霍氏肠杆菌Eubacterium_hallii_DSM_3353，梭菌Clostridium_SS2_1，瘤胃球菌Ruminococcus_5_1_39BFAA和凸腹真杆菌Eubacterium_ventriosum_ATCC_27560。本发明还公开一种利用大肠癌标志物确定个体状态的方法及装置。相较于大肠癌群体，所称的大肠癌标志物在健康群体中显著富集，能够作为健康群体和大肠癌患者群体的区分标志。
技术领域
本发明涉及生物标志物领域，具体的，本发明涉及大肠癌生物标志物及其应用，更具体的，本发明涉及一种大肠癌标志物、大肠癌标志物的用途、一种利用大肠癌标志物确定个体的状态的方法、一种利用大肠癌标志物确定个体的状态的装置、一种利用大肠癌标志物对多个个体进行分类的方法、一种治疗大肠癌的药物以及一种制备治疗大肠癌药物的方法。
背景技术
大肠癌(Colorectal Cancer，CRC)是源自结肠或直肠(为大肠的一部分)的癌症，因为细胞不正常的生长，可能侵犯或转移至身体其他部位。大肠癌患者经常出现粪便中带血、排便习惯改变、体重减轻、以及疲倦感等症状。大肠癌为第三常见癌症，约占10％。在2012年，美国有140万例新诊断的大肠直肠癌，且造成69.4万人死亡。大肠直肠癌在发达国家较为常见，占全世界总案例数的65％。而在女性较男性少见。近几年，我国结直肠癌的发病率呈明显上升趋势。据统计，2002年，我国结肠癌的发病率仅为7％，预计到2015年，这个数字将变成13％，发病率翻了近一番。与西方人相比，我国直肠癌比结肠癌发病率高，约1.5∶1；青年人(<30岁)患者比例较高，约占15％。
75～95％的大肠癌发病人群没有或少见遗传因素；其他危险因素包括年龄增大、男性、高脂肪摄入量、酒精或红肉、超重、吸烟和缺乏体育锻炼；大约10％的病例与缺乏运动有关(Watson A J et al 2010；Cunningham D et al 2010)。饮酒的危害在超过每天一杯后逐步提升。
肠道微生物对于肠道上皮细胞起到重要作用，包括形成微生物屏障防止病原菌定植、执行免疫调节及代谢功能。有研究表明肠道菌群失衡会通过不同形式导致大肠癌的发生，病原微生物会通过激活识别受体、吸附、分泌肠毒素或侵入等方式引起肠道炎症反应。肠道微生物数量、结构及稳定性的改变，尤其是菌群的失衡会改变正常的生理功能从而引发肠道疾病，包括大肠癌。
大肠癌诊断包主要有三类：X线检查；乙状结肠镜和纤维结肠镜检查以及癌胚抗原(cea)试验；癌胚抗原(cea)试验对早期病例的诊断价值不大；而肠镜检查虽然准确性高，但很多高危人群因为不愿接受痛苦的肠镜而拒绝1-2年的定期筛查。有研究通过检测血液内Mir-92因子的含量，可检测验血者是否有大肠癌，但健康人士的错误检测率达到30％。随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为结肠癌诊断的方向。基因筛查对发现结肠癌潜在人群很有优势，但发现基因缺损后1-2年仍需接受肠镜诊断。结肠癌在早期并无明显症状，目前缺乏有效的无创大肠癌早期诊断方法。
发明内容
本发明旨在至少在一定程度上解决上述技术问题之一或至少提供一种商业选择。
依据本发明的第一方面，本发明提供一种大肠癌标志物，所述大肠癌标志物包括以下微生物中的至少两种：霍氏肠杆菌Eubacterium_hallii_DSM_3353，梭菌Clostridium_SS2_1，瘤胃球菌Ruminococcus_5_1_39BFAA和凸腹真杆菌Eubacterium_ventriosum_ATCC_27560。
上述本发明一方面提供的大肠癌标志物是发明人通过对大量大肠癌个体和大量健康对照个体的粪便样本中的微生物的丰度的差异比较分析、以及验证，而确定下来的，明确了肠道微生物中大肠癌相关的微生物标志物。利用所称的大肠癌标志物，能够确定个体处于患有大肠癌状态的概率或者处于健康状态的概率，能够用于非侵入性的早期发现或辅助检测大肠癌。
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- 本发明提供了一种快速检测产四环素类药物失活酶的菌株的方法。所述方法包括如下步骤：S1.制备涂布指示菌的培养基，其中，指示菌为加入四环素类抗生素后不能生长或显著抑制生长的菌株；S2.将四环素类抗生素溶液分别与待测菌株菌苔、阴性对照菌株菌苔共同孵育；S3.在步骤S1的培养基上打孔并封底，将步骤S2孵育后的溶液进行离心，加入孔内孵育，对产生的抑菌圈进行对照，同时设置空白组。本发明的检测方法操作简单、分析快速、适用范围广、准确性和特异性高、结果易于判读。同时，本发明还可以提供基于所述快速检测方法建立的检测试剂盒，对于及早发现含有四环素类药物失活酶的菌株并采取有效措施，对医院感染控制及临床流行病学检测具有重要意义，应用前景良好。
- 用于饮食干预或粪便微生物群移植治疗肠易激综合征的伴随诊断方法-201780063672.9
- F·T·海格;C·卡森;J·瓦勒;A·若瑟;M·C·斯姆斯图恩 - 遗传分析股份有限公司
- 2017-10-13 - 2019-08-09 - C12Q1/04
- 本发明提供了一种诊断方法，该方法可用于确定患有肠易激综合征(IBS)的受试者对利用IBS干预饮食或粪便微生物群移植(FMT)治疗有反应的可能性。特别地，该方法可用于预测或确定IBS患者对利用IBS干预饮食或FMT治疗有阳性反应的可能性，尤其是用于确定饮食干预或FMT对受试者的胃肠道、特别是胃肠道微生物群、或IBS的其它症状或并发症可能具有阳性(即有益)作用的可能性(例如降低其严重性)。本发明的方法基于分析胃肠道样品中某些细菌的丰度，例如通过核酸分析进行。
- 一种真菌荧光染色剂-201610318825.7
- 柳丽;赖增祖;叶欣 - 南京汉瑞生物科技有限公司
- 2016-05-13 - 2019-08-06 - C12Q1/04
- 本发明公开了一种真菌荧光染色剂，包括荧光增白剂、背景染料以及稳定成分。本发明产品稳定性好，能够实现一滴快速染色，并且不受标本限制，对于大块、深部样本均适用，大大提高真菌检测效率。
- 一种啤酒有害菌选择性培养基及其应用-201611025214.X
- 罗娜;李惠萍;涂京霞;张晓辉;熊丹;陈君;刘静;黄思鸿 - 广州南沙珠江啤酒有限公司
- 2016-11-18 - 2019-08-02 - C12Q1/04
- 本发明提供一种啤酒有害菌选择性培养基及其应用，每1L培养基中包括如下添加量的各组分：蛋白胨8‑13g、酵母浸膏2‑6g、番茄汁肉汤3‑9g、吐温‑80 1‑4g、果糖4‑10g、麦芽糖8‑16g、葡萄糖12‑16g、磷酸二氢钾0.5‑1.2g、氯化钠0.003‑0.009g、七水合硫酸亚铁0.01‑0.06g、乙酸钾4‑9g、L‑半胱氨酸盐酸盐0.2‑0.7g、甜菜碱HCl 1‑3g、正乙酰葡糖胺0.2‑0.4g、碳酸钙0.001‑0.006g、苹果酸0.5‑1.0g、柠檬二酸胺1‑3g、溴甲酚绿30‑80ppm、放线菌酮8‑20ml、精氨酸0.5‑2.0g、叶酸0.1‑1.0g。本发明提供的培养基是一种适合中国啤酒高辅料比、低苦味值、低酒精度等特点的选择性啤酒有害菌培养基，利用该培养基能快速、准确地检测出啤酒中存在的啤酒有害菌。
- 一种有机硅材料在制备微生物检测产品中的应用-201610938976.2
- 李芳;彭晰钰;彭志刚 - 上海美凯纯生物科技有限公司
- 2016-10-25 - 2019-07-30 - C12Q1/04
- 本发明公开了一种有机硅材料在制备微生物检测产品中的应用，所述的有机硅材料包括基础聚合物、交联剂和催化剂，其中基础聚合物是指含乙烯基的有机聚硅氧烷；所述交联剂是指含硅氢键的有机聚硅氧烷；所述催化剂是指有机锡类催化剂、铂系催化剂、或钛酸酯及其配合物催化剂；各组分的含量为：78wt%‑99wt%基础聚合物，0.5wt%‑20wt%交联剂，0.5wt%‑2wt%催化剂。所述微生物检测产品是采用有机硅材料和颜色指示剂溶液制成的传感器。本发明是将具有高透气性特点的有机硅材料引入微生物检测领域，结合颜色指示剂，制成传感器，使其具有检测微生物小分子代谢产物的功能，并且相比较平板培养法而言明显缩短了检测时间。
- 用于灭菌指示的生物指示剂及其制备方法-201910056608.9
- 陈缵光;马宽霞 - 中山大学
- 2019-01-21 - 2019-07-26 - C12Q1/04
- 本发明为一种用于灭菌指示的生物指示剂及其制备方法，对高压蒸汽灭菌过程的有效性进行检测。灭菌生物指示剂是由封装有菌片的塑料管和封装有复原培养基的玻璃管组成，二者在使用前独立存在，互不干扰。菌片由指示微生物和染菌载体组成，指示微生物为嗜热脂肪地芽孢杆菌，染菌载体为玻璃纤维滤纸，复原培养基由胰蛋白胨、大豆蛋白胨、酵母提取物、氯化钠、溴甲酚紫、4‑甲基伞形酮‑α‑D‑吡喃葡糖苷、L‑丙氨酸、L‑缬氨酸、蒸馏水等组成塑料管为顶部开有通气孔的半透明耐高温型交联塑料管，并覆透气膜，使消毒过程中高压蒸汽能够与菌片充分接触。具有制备简单，原料易得，结果可靠等优点。
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