[发明专利]一种翘嘴红鲌DNA条形码序列及其应用在审
申请号: | 201810829918.5 | 申请日: | 2018-07-25 |
公开(公告)号: | CN109055407A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
发明(设计)人: | 刘红艳;熊飞 | 申请(专利权)人: | 江汉大学 |
主分类号: | C12N15/53 | 分类号: | C12N15/53;C12Q1/6888 |
代理公司: | 北京华沛德权律师事务所 11302 | 代理人: | 房德权 |
地址: | 430056 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 翘嘴红鲌 细胞色素c氧化酶亚基I 标准检测序列 物种鉴定 应用 物种 基因 | ||
本发明公开了一种翘嘴红鲌DNA条形码序列及其应用,属于物种鉴定技术领域。所述翘嘴红鲌DNA条形码序列为SEQ ID NO:1。所述翘嘴红鲌DNA条形码序列为翘嘴红鲌COI(cytochrome c oxidase subunit I,细胞色素c氧化酶亚基I)基因。该DNA条形码序列可以作为翘嘴红鲌DNA的标准检测序列,有效的对翘嘴红鲌物种进行鉴定。
技术领域
本发明属于物种鉴定技术领域,具体涉及一种翘嘴红鲌DNA条形码序 列及其应用。
背景技术
翘嘴红鲌(Erythroculter ilishaeformis),隶属鲤科(Cyprinidae) 鲌亚科(Culterinae)红鲌属(Erythroculter),主要分布于长江水系。 翘嘴红鲌为广温性鱼类,适应性与抗病力强,生长迅速,体型较大,属中、 上层大型淡水经济鱼类。鲌亚科鱼类往往由于形态学特征的相似,不同种 属的鱼类常常会产生混淆,难以区分,因此,有必要对物种进行有效的鉴 定。
DNA条形码是指生物体内能够代表该物种的、有足够变异的、标准的、 易扩增并且相对较短的DNA片段,可以快速、准确的进行物种鉴定。线 粒体DNA的COI基因具有长度适中、进化速率适中和富含系统进行发育信 息等特点。在研究中,能够较好地对物种的COI基因片段进行有效扩增。 因此,在动物物种分类和鉴定中,COI基因作为条形码应用有很大的潜力。
物种鉴定一直是分类学乃至几乎所有生物领域上的研究至关重要的 基础步骤。因此,准确的对物种鉴定和分类就显得尤其重要。目前,各国 研究者已经开展了从湖泊到海洋不同地理区域的鱼类DNA条形码研究计 划,研究表明DNA条形码在物种鉴定方面具有高效可行性。大量的研究结 果显示以COI基因为标记的DNA条形码能够准确的对各类动物进行物种鉴 定,可以选用COI基因作为各种动物条形码数据库的标准条形码。
在实际操作中,往往会遇到标本量较少以及样本保存不完整等问题, 这样给传统的物种分类和鉴定研究带来了很大的困难。在现有的技术中 心,均没有翘嘴红鲌DNA条形码序列以及翘嘴红鲌COI基因作为翘嘴红鲌 DNA条形码标准检测序列的记载和报道。
采用DNA条形码结合传统的分类学方法,对物种高效准确的鉴定和分 类起着重要的作用。
发明内容
本发明目的是提供一种可以作为翘嘴红鲌DNA的标准检测序列,能够 有效的对翘嘴红鲌物种进行鉴定。
本发明所采用的技术方案是:
一种翘嘴红鲌DNA条形码序列,所述序列为SEQ ID NO:1。
优选地,所述翘嘴红鲌DNA条形码序列为翘嘴红鲌COI(cytochrome c oxidasesubunit I,细胞色素c氧化酶亚基I)基因。
一种翘嘴红鲌DNA条形码标准检测序列的应用,该DNA条形码序列可 以作为翘嘴红鲌DNA的标准检测序列,有效的对翘嘴红鲌物种进行鉴定。
本发明具有以下优点:
本发明所得到的翘嘴红鲌DNA条形码序列可以作为翘嘴红鲌DNA的标 准检测序列,对翘嘴红鲌物种高效和准确的进行鉴定和分类。在实际工作 中,有时要进行鱼卵和鱼苗的物种鉴定,鱼卵很难通过传统的形态学方法 进行鉴定,另外处于生长发育期的鱼苗形态特征也还不是很显著,无法通 过传统的形态学进行鉴定的时候,这时借助于物种的DNA标准条形码,就 很容易对该物种的鱼卵和鱼苗进行鉴定。有时在物种鉴定的时候,会遇到样本不完整或残缺不全,也给传统的物种分类和鉴定带来困难,这时借助 于物种的DNA标准条形码,可以很快的进行准确的鉴定。有时同一属內甚 至亚科内的不同物种形态相似,有时会出现同一物种,会错误的把它界定 为不同的物种,或者不同的物种,错误的把它界定为同一物种,分类关系 混乱,利用该物种的标准条形码可以方便快捷的对其物种进行准确的鉴 定。
具体实施方式
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- 海带钒离子依赖型卤素过氧化物酶基因及其编码蛋白-201610565700.4
- 刘涛 - 中国海洋大学
- 2016-07-18 - 2019-08-02 - C12N15/53
- 本发明涉及基因工程技术领域,具体是一种海带钒离子依赖型卤素过氧化物酶基因,该基因核苷酸序列及编码蛋白质的氨基酸序列分别为SEQ ID NO:1‑37和SEQ ID NO:38‑74。本发明通过转录组测序技术结合序列分析技术获得基因序列,构建原核表达载体,通过对重组蛋白进行酶活性检测,证实了其具有非常高的碘代过氧化物酶活性,无溴代过氧化物酶和氯代过氧化物酶活性。该基因对于提高海带等藻类中的碘含量具有重要的应用价值。
- 编码生物膜形成抑制蛋白质的基因和使用具有失活基因的细菌菌株生产L-赖氨酸的方法-201410543331.X
- 河云焕;金容材;李政训;申喜星;文准玉;金亨俊;李光镐 - CJ第一制糖株式会社
- 2014-10-15 - 2019-08-02 - C12N15/53
- 本发明涉及源自棒杆菌细菌的新的分离的基因(多核苷酸),其编码具有生物膜形成抑制活性的蛋白质;其中多核苷酸失活的产L‑赖氨酸的菌株;和使用其生产L‑赖氨酸的方法。
- 植物亚麻酸合成酶基因CsFAD2-2及其应用-201910202885.6
- 李海燕;王法微;崔景焱;李晓薇;刘伟灿;王南 - 吉林农业大学
- 2019-03-18 - 2019-07-30 - C12N15/53
- 本发明公开了植物亚麻酸合成酶基因CsFAD2‑2,它的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示;一种表达载体,它插入了序列表SEQ NO.1所示的基因;所述的植物亚麻酸合成酶基因CsFAD2‑2提高植物物亚麻酸的含量的应用;以亚麻芥cDNA为模板,利用反转录PCR技术克隆CsFAD2‑2基因;该基因可以能够将植物体内的油酸及亚油酸催化生成亚麻酸,其过表达的转基因植株中亚麻酸含量较野生型植株高1.56倍;为基因工程育种以提高作物亚麻酸含量提供优质的候选基因。
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