[发明专利]一种DNA编码化合物脱除苄基的方法在审

专利信息
申请号: 202111353662.3 申请日: 2021-11-17
公开(公告)号: CN116136032A 公开(公告)日: 2023-05-19
发明(设计)人: 李进;蔡坤良;赵钱梅;高森 申请(专利权)人: 成都先导药物开发股份有限公司
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C07H1/00;C07H21/04;C40B50/10
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 编码 化合物 脱除 苄基 方法
【说明书】:

发明涉及一种DNA编码化合物脱除苄基的方法,该方法以On‑DNA含有苄基保护的氨基和/或羟基化合物为原料,在钯催化剂、氢源存在条件下反应得到On‑DNA含有氨基和/或羟基的化合物。本发明提供的DNA编码化合物脱除苄基的方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行,后处理简单,条件温和,能够在较短时间内高收率得到高多样性的DNA编码化合物库,并且适用于多孔板进行的DNA编码化合物的合成。

技术领域

本发明属于编码化合物库技术领域,具体涉及一种DNA编码化合物库中构建On-DNA脱除苄基的方法。

背景技术

在药物研发,尤其是新药研发中,针对生物靶标的高通量筛选是快速获得先导化合物的主要手段之一。然而,基于单个分子的传统高通量筛选所需时间长、设备投入巨大、库化合物数量有限(数百万),且化合物库的建成需要数十年的积累,限制了先导化合物的发现效率与可能性。近年来出现的DNA编码化合物库技术(WO2005058479、WO2018166532、CN103882532),结合了组合化学和分子生物学技术,在分子水平上将每个化合物加上一个DNA标签,并能在极短的时间内合成高达亿级的化合物库,成为下一代化合物库筛选技术的趋势,并开始在制药行业广泛应用,产生了诸多积极的效果(Accounts of ChemicalResearch,2014,47,1247-1255)。

DNA编码化合物库通过组合化学快速产生巨型化合物库,并且能高通量地筛选出先导化合物,使得先导化合物的筛选变得前所未有的快捷和高效。构建DNA编码化合物库的挑战之一就是需要在DNA上高收率地合成具有化学多样性的小分子。由于DNA需要在一定的条件下(溶剂、pH、温度、离子浓度)才能维持稳定,同时应用于DNA编码化合物库构建的On-DNA反应还需要有较高的产率。因此DNA上进行的化学反应(简称On-DNA反应)的试剂种类、反应种类、反应条件直接影响到DNA编码化合物库的丰富度和可选择性。从而开发能够与DNA兼容的化学反应也成为目前DNA编码化合物库技术的长期探索和研究方向,也直接影响了DNA编码化合物库的应用及商业价值。

开发DNA编码化合物脱除苄基的方法可以丰富氨基和羟基的使用场景,从而进一步扩展化合物库的多样性,有利于提高筛选到有效化合物的概率。然而目前并没有报道DNA编码化合物脱除苄基的方法。因此希望开发一种新的适用于大批量多孔板操作的DNA编码化合物脱除苄基的合成方法,以增加DNA编码化合物库的多样性,进一步提升DNA编码化合物库技术的应用价值。

发明内容

为了解决上述问题,本发明开发了一种原料稳定存储、反应条件温和、底物普适性好,对DNA损伤小,适合于使用多孔板进行批量操作的DNA编码化合物库的合成方法,可以快速将On-DNA含有苄基保护的氨基和/或羟基化合物库通过一步反应转化为On-DNA含有氨基和/或羟基化合物库。

本发明提供了一种DNA编码化合物脱除苄基的方法,所述方法以On-DNA含有苄基保护的氨基和/或羟基化合物为原料,在钯催化剂、氢源存在下反应得到On-DNA含有氨基和/或羟基化合物化合物。

其中,On-DNA含有苄基保护的氨基或羟基化合物的结构式为On-DNA含有氨基或羟基的化合物的结构式为

其中,结构式中DNA包含由人工修饰的和/或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链的核苷酸链,该核苷酸链通过一个或多个化学键或基团与R1或R3相连;

所述DNA的长度为10~200个碱基。

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