[发明专利]一种长链非编码RNA亚细胞定位的预测方法在审
| 申请号： | 201910688416.X | 申请日： | 2019-07-29 |
| 公开（公告）号： | CN110415765A | 公开（公告）日： | 2019-11-05 |
| 发明（设计）人： | 樊永显;陈梅君;朱庆祺;徐海波;崔娟 | 申请（专利权）人： | 桂林电子科技大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B5/00 |
| 代理公司： | 桂林市华杰专利商标事务所有限责任公司 45112 | 代理人： | 杨雪梅 |
| 地址： | 541004 广西*** | 国省代码： | 广西;45 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种长链非编码RNA亚细胞定位的预测方法，包括如下步骤：1）特征提取；2）选取特征子集及特征参数；3）提取最优特征集；4）用逻辑回归作为预测模型对最优特征集进行预测，从而实现对长链非编码RNA亚细胞的定位预测。这种方法预测速度快、预测准确率高。 | ||
| 搜索关键词： | 预测 非编码RNA 长链 亚细胞定位 特征集 逻辑回归 特征参数 特征提取 特征子集 预测模型 亚细胞 准确率 | ||
【主权项】：
1.一种长链非编码RNA亚细胞定位的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：1）特征提取：在细胞核，细胞质，核糖体和外泌体四个亚细胞位置获取数据集，采用 k联体核苷酸组分方法、伪二核苷酸组分方法和局部结构‑序列三元组方法这三种方法对数据集中的长链非编码 RNA序列进行编码，得到k联体核苷酸组分特征、伪二核苷酸组分特征和局部结构‑序列三元组特征；2）选取特征子集及特征参数：对k联体核苷酸组分特征采用二项分布方法进行筛选，按照二项分布置信度高低对k联体核苷酸组分特征进行排序，再用增量添加特征策略，逐步添加置信度高的特征进行训练，得到最佳数量的k联体核苷酸组分特征子集，然后对伪二核苷酸组分特征进行参数调整，选取伪二核苷酸组分特征的最佳参数；3）提取最优特征集：将步骤1）中的局部结构‑序列三元组特征和步骤2）筛选得到的k联体核苷酸组分特征子集、最佳参数下的伪二核苷酸组分特征合并，采用F‑score方法对合并特征集的每个特征进行评分，将特征按照得分高低重新排序，再用增量添加特征策略，逐步添加得分高的特征进训练集，优化提取特征，得到最优特征集；4）用逻辑回归作为预测模型对最优特征集进行预测，从而实现对长链非编码RNA亚细胞的定位预测。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于桂林电子科技大学，未经桂林电子科技大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201910688416.X/，转载请声明来源钻瓜专利网。
