[发明专利]一种基于增强子和启动子数据预测关键转录因子的方法在审
申请号: | 202310081441.8 | 申请日: | 2023-01-16 |
公开(公告)号: | CN116129996A | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
发明(设计)人: | 方皓舒;朱亚玲;孟蕾蕾;马金虎 | 申请(专利权)人: | 安徽医科大学 |
主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B25/10;G16B50/00 |
代理公司: | 合肥天明专利事务所(普通合伙) 34115 | 代理人: | 汪贵艳 |
地址: | 230032*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于增强子和启动子数据预测关键转录因子的方法,其包括以下步骤:获得基因增强子序列的FASTA格式文件;根据基因转录起始位点的位置信息,获取基因启动子序列的FASTA格式文件;将基因增强子序列和启动子序列的FASTA格式文件分别导入转录因子在线预测系统PROMO,得到靶向结合增强子的转录因子和靶向结合启动子的转录因子;筛选出同时靶向结合增强子和启动子的整合转录因子;构建整合转录因子的蛋白质相互作用网络;筛选处于核心位置的转录因子作为调控基因表达的关键转录因子。本发明能够通过整合增强子和启动子数据而准确、快速地预测出调控基因表达的关键转录因子,并具有更高的预测准确性。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 增强 启动子 数据 预测 关键 转录 因子 方法 | ||
【主权项】:
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