[发明专利]一种基于非线性深度自编码器的空间转录组空间域划分方法及系统在审
申请号: | 202310488410.4 | 申请日: | 2023-04-28 |
公开(公告)号: | CN116525003A | 公开(公告)日: | 2023-08-01 |
发明(设计)人: | 彭有梅;黄津津;付小倩;张壮丽;李建波;杨洋;王修霞;张艳;刘尚坤;谢银峰;王娅蓉 | 申请(专利权)人: | 郑州大学 |
主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B25/10;G16B40/00;G16B40/20;G06F18/23;G06F18/214;G06F18/241;G06N3/0455;G06N3/0464;G06N3/09 |
代理公司: | 郑州明华专利代理事务所(普通合伙) 41162 | 代理人: | 袁艳丽 |
地址: | 450000 河南省郑州*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于非线性深度自编码器的空间转录组空间域划分方法及系统,涉及生物信息学技术领域,包括以下步骤:步骤一、对空间转录数据处理得到增强基因表达谱以及邻接矩阵;步骤二、利用噪声函数使增强基因表达谱产生干扰噪声并与增强基因表达谱共用邻接矩阵;步骤三、构建非线性深度自编码器模型,并进行模型训练;步骤四、构建自适应神经网络并嵌入非线性深度自编码器中用于处理批次效应;步骤五、将正样本数据输入到训练好的非线性深度自编码器模型中以得到潜在嵌入特征,并进行聚类以生成聚类标签;本发明有效提高了空间转录组数据空间域划分的精度,有效克服了批次效应,适用于多种空间转录组平台。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 非线性 深度 编码器 空间 转录 划分 方法 系统 | ||
【主权项】:
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