[发明专利]混样测序的方法及装置、电子设备和存储介质

说明书

本公开提供了一种混样测序的方法及装置、电子设备和存储介质，在同一测序芯片中，在对第一待测序文库进行测序处理得到第一测试序列集后，对第二待测序文库进行测序处理得到第二测试序列集；对测试序列集中的测试序列进行序列组装；对每种组装序列集进行评估，得到每种待测序样本各自对应的组装序列；基于组装序列之间的相似度，确定待测序样本各自对应的组装序列。本公开实施例通过将第一待测序文库与第二待测序文库在同一张测序芯片中连续进行测序后，对测序得到的序列进行组装、评估后得到第一待测序文库对应的组装序列、第二待测序文库对应的组装序列；本公开可以减少相邻两个批次测序时清洗测序芯片花费的时间，提高测序的效率。

技术领域

本公开涉及数据处理技术领域，尤其涉及一种混样测序的方法及装置、电子设备和存储介质。

背景技术

Nanopore测序技术与先前测序技术相比，测序过程无需进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction，PCR)扩增，实现了对每一条脱氧核糖核酸(DeoxyriboNucleicAcid，DNA)分子的单独测序；可以减少构建文库的过程、提高测序的效率。而Nanopore测序技术具有读长更长、运行速度快以及能够实时获取序列信息等特点。在同张测序芯片中，采用单条形码(barcode)最多支持96种样本混样建库；而Nanopore测序芯片支持可清洗重复使用，即在对相邻的两个批次的样本进行测序时，在完成第一批次的测序后对测序芯片进行清洗后，可基于清洗后的芯片继续执行第二批次的测序，但是由于每次清洗所使用的试剂、人工及相关的物料成本高昂，且清洗花费时间较长，影响测序的效率。

发明内容

本公开提供了一种混样测序的方法及装置、电子设备和存储介质。其主要目的在于实现不同批次之间的测序，不需清洗测序芯片直接混样测序。

根据本公开的第一方面，提供了一种混样测序的方法，其中，包括：

在同一测序芯片中，在对第一待测序文库进行测序处理得到至少一种第一测试序列集后，对第二待测序文库进行测序处理得到至少一种第二测试序列集；其中，所述第一待测序文库包括至少一种第一待测序样本，所述第二待测序文库包括至少一种第二待测序样本；

对每种所述第一测试序列集中的测试序列进行序列组装，得到每种所述第一待测序样本对应的第一组装序列集；对每种所述第二测试序列集中的测试序列进行序列组装，得到每种所述第二待测序样本对应的第二组装序列集；

对每种所述第一组装序列集进行评估，得到每种所述第一待测序样本各自对应的第一组装序列；对每种所述第二组装序列集进行评估，得到每种所述第二待测序样本各自对应的第二组装序列、第三组装序列；

基于至少一种所述第一组装序列分别与至少一种所述第二组装序列、至少一种所述第三组装序列之间的相似度，确定所述至少一种第一待测序样本各自对应的组装序列、所述至少一种第二待测序样本各自对应的组装序列。

可选的，在对第二待测序文库进行测序处理得到至少一种第二测试序列集之后，所述方法还包括：

在所述同一测序芯片中，继续对第三待测序文库进行测序处理得到至少一种第三测试序列集；其中，所述第三待测序文库包括至少一种第三待测序样本；

对每种所述第三测试序列集中的测试序列进行序列组装，得到每种所述第三待测序样本对应的第三组装序列集；

对每种所述第三组装序列集进行评估，得到每种所述第三待测序样本各自对应的第四组装序列、第五组装序列、第六组装序列；

基于所述至少一种第一待测序样本各自对应的组装序列、所述至少一种第二待测序样本各自对应的组装序列分别与所述第四组装序列、所述第五组装序列、所述第六组装序列之间的相似度，确定所述至少一种第三待测序样本各自对应的组装序列。