[发明专利]用于血浆游离RNA分析的多种方法在审
申请号: | 202180039805.5 | 申请日: | 2021-06-16 |
公开(公告)号: | CN115698321A | 公开(公告)日: | 2023-02-03 |
发明(设计)人: | 露丝·E·蒙兹;马修·拉森;阿卡纳·雪诺伊;阿拉什·詹姆席狄;大卫·伯克哈特 | 申请(专利权)人: | 格里尔公司 |
主分类号: | C12Q1/6809 | 分类号: | C12Q1/6809;C12Q1/6886 |
代理公司: | 上海翼胜专利商标事务所(普通合伙) 31218 | 代理人: | 翟羽 |
地址: | 美国加*** | 国省代码: | 暂无信息 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 提供了测量多个血浆游离(cell‑free)核糖核酸(RNA)分子的多个亚群的多种方法。在一些实施例中,提供了从获自一受试者的一测试样本中的多个RNA分子生成一测序文库的多种方法,以及用于分析所述测序文库以检测,例如一疾病的所述存在或不存在的多种方法。 | ||
搜索关键词: | 用于 血浆 游离 rna 分析 多种 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于格里尔公司,未经格里尔公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/202180039805.5/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 用于分析物分析的系统和方法-202180090649.5
- H·恩古延;洪儒菘;L·姜 - 康比纳蒂股份有限公司
- 2021-12-28 - 2023-09-19 - C12Q1/6809
- 本公开提供了用于分析分析物的方法和系统。分析分析物可包括使分析物与结合试剂接触,该结合试剂可包括:对该分析物具有特异性的结合探针,和核酸分子。可使该核酸分子变性,并且可收集指示该分析物的该变性的信号。这些收集的信号可用于检测、鉴定或定量该分析物。
- 一种分析经固定的细胞的组分的方法-202180060435.3
- 施威扬 - 上海绾塍生物科技有限公司
- 2021-08-05 - 2023-06-23 - C12Q1/6809
- 提供了一种分析经固定的细胞的组分的方法,其包括将至多1个所述经固定的细胞和包含多核苷酸的粒子一同包裹在分隔区中,所述粒子包含的所述多核苷酸含有至少一种识别序列以及至少一种捕获序列,所述捕获序列能够直接或间接捕获所述细胞中的组分或其部分;在使得所述分隔区中的所述细胞组分或其部分解交联、且在使经解交联的所述细胞组分或其部分被所述捕获序列捕获的条件下孵育所述分隔区;从所述分隔区中释放所述粒子;通过分析经释放的所述粒子上的多核苷酸序列来分析所述经固定的细胞的组分或其成分。还提供了一种用于分析经固定的细胞的组分的试剂盒,以及一种分析经固定的细胞的组分的系统。
- 鉴定核酸条形码的方法-202180058076.8
- S·W·里德;E·D·哈林顿 - 牛津纳米孔科技公开有限公司
- 2021-08-06 - 2023-05-05 - C12Q1/6809
- 提供了一种方法,其包括:对于一个或多个靶标核酸和一个或多个参考核酸的每个相应对,在相应靶标核酸的片段与相应参考核酸的片段之间生成比对,其中所述相应参考核酸包括相应的条形码序列和相应的第一上下文序列。对于每对,确定所述参考核酸的评分区域与所述靶标核酸的对应片段之间的序列相似性。对于每对,基于所述靶标核酸与所述参考核酸的所述评分区域之间的所述序列相似性,确定所述靶标核酸是否包括所述参考核酸的所述条形码序列。
- 用于血浆游离RNA分析的多种方法-202180039805.5
- 露丝·E·蒙兹;马修·拉森;阿卡纳·雪诺伊;阿拉什·詹姆席狄;大卫·伯克哈特 - 格里尔公司
- 2021-06-16 - 2023-02-03 - C12Q1/6809
- 提供了测量多个血浆游离(cell‑free)核糖核酸(RNA)分子的多个亚群的多种方法。在一些实施例中,提供了从获自一受试者的一测试样本中的多个RNA分子生成一测序文库的多种方法,以及用于分析所述测序文库以检测,例如一疾病的所述存在或不存在的多种方法。
- 特应性皮炎的检测方法-202180032407.0
- 深川聪子;志摩恭子;高田直人;井上高良;石川准子;桑野哲矢 - 花王株式会社
- 2021-04-28 - 2022-12-16 - C12Q1/6809
- 本发明提供一种用于检测特应性皮炎的标记和使用该标记的特应性皮炎的检测方法。被检验者的特应性皮炎的检测方法包括测定从该被检验者采集的生物体试样所含的基因或其表达产物的表达水平的工序。
- 用于鉴定功能性疾病特异性调节性T细胞的方法-202180027461.6
- E·皮亚乔;W·里歇尔;C·赛德利克;J·托塞罗;J·瓦特法尔;E·博南 - 居里研究所;国家医疗保健研究所;蒙苏里互助研究所
- 2021-02-22 - 2022-12-02 - C12Q1/6809
- 本发明涉及鉴定功能性疾病特异性,特别是肿瘤特异性调节性T细胞及其标志物的方法。本发明还涉及衍生的功能性肿瘤特异性调节性T细胞、标志物和工程化的调节性T细胞,以及它们用于诊断、预后、监测和治疗癌症的用途。
- 用于识别临床和非临床环境中微生物的方法-202080094290.4
- 安德烈斯·爱德华特·布丁 - 佰优米利斯卡皮塔尔格鲁普有限公司
- 2020-12-02 - 2022-11-08 - C12Q1/6809
- 本发明涉及一种通过聚合酶链式反应(PCR)来识别生物样品中微生物的方法,包括以下步骤:a)提供疑似包含微生物的生物样品,并且可选地从所述生物样品分离核酸序列;b)使用广泛分类范围扩增引物组来PCR扩增所述经可选地分离的核酸序列中所包含的至少一种微生物rRNA内转录间隔(ITS)区,从而由微生物来源的核酸序列来产生PCR扩增子;c)记录PCR扩增子的高分辨率熔解曲线,并记录所述PCR扩增子的长度;d)将所述高分辨率熔解曲线与含已知微生物种或株的参考扩增子的高分辨率熔解曲线的数据库进行比较,从而得到第一识别指标;e)将具有不同长度的每种PCR扩增子的长度与含已知微生物种或株的参考扩增子的PCR扩增子长度的数据库进行比较,从而得到第二识别指标;以及f)当所述第一识别指标与所述第二识别指标匹配时,则将所述样品中存在的微生物识别为种或株水平。
- 用于检测卵巢癌的组合物和方法-202180019123.8
- J·C·塞德拉克;L·T·博尔托林;D·P·塞勒姆 - 仁慈生物分析公司
- 2021-01-16 - 2022-11-01 - C12Q1/6809
- 本公开一方面提供了用于检测卵巢癌(例如,早期检测卵巢癌)的技术。在另一方面,本文提供的技术可用于选择和/或监测和/或评估施用于确定患有或易患卵巢癌的受试者的治疗的功效。在一些实施方案中,本文提供的技术可用于开发伴随诊断,例如,通过结合治疗测量肿瘤负荷和肿瘤负荷的变化。在一些实施方案中,本文提供的技术可用于开发伴随诊断,例如,通过鉴定妇女血液样品中与治疗反应相关的生物标记物。
- 估计循环肿瘤DNA负荷的方法以及相关的试剂盒和方法-202080087122.2
- A·斯坎德拉普;朱冠华;黄雯诗;陈美发 - 新加坡科技研究局
- 2020-12-18 - 2022-09-16 - C12Q1/6809
- 提供了估计受试者中循环肿瘤DNA(ctDNA)负荷/水平的方法,该方法包括:确定从受试者获得的血液样品中映射到一个或多个核小体缺失区(NDR)的无细胞DNA(cfDNA)的水平;以及基于所述cfDNA水平估计ctDNA负荷,其中所述NDR(i)包括其转录物在健康血液组织与肿瘤组织之间差异表达的基因的NDR,并且/或者(ii)在健康血液组织与荷瘤受试者的血液组织之间降解至不同程度。还提供了相关的试剂盒和方法,在一个实施方案中,所述一个或多个NDR包括选自下述基因的一个或多个NDR:SLC11A1、NLRP12、PRTN3、HMBS、LILRB3、ACSL1、GP9、MX2、RASGRP4、ATG18L2、SHKBP1、BCAR1、RAB25和LSR。
- 检查脑肿瘤的方法-202080075280.6
- 安井隆雄;马场嘉信;夏目敦至 - 科莱鹤株式会社
- 2020-09-24 - 2022-07-08 - C12Q1/6809
- 本发明提供脑肿瘤的新的生物标志物及其利用方法。一种检查方法,其为检查脑肿瘤的方法,其包括检测特定的miRNA作为生物标志物的步骤。
- 核苷酸序列变体的频率分布的确定-201980024872.2
- D·尤多维克;J·拉森 - 泰格丘公司
- 2019-04-02 - 2022-06-14 - C12Q1/6809
- 公开了一种用于确定样本的多个核苷酸序列变体(与核苷酸参考序列在至少一个中间部分上不同)的频率分布的方法。通过对参考变体列表的每个序列参考变体执行多个参考序列读取(每个具有读取起始位置RSS)生成序列读取数据的参考集。(对每个RSS和每个序列参考变体的中间部分)确定中间部分是否通过对应参考序列读取可检测。通过对样本执行样本序列读取来生成序列读取数据的样本集,并且对每个RSS和每个序列参考变体的中间部分确定在样本集中的总出现次数。对能够检测中间部分的RSS,基于确定的出现次数确定多个核苷酸序列变体的频率分布。
- 用于乳腺癌的预后和预测来自辅助放射疗法的益处的方法和基因组分类器-201980087717.5
- S·L·常;L·J·皮尔斯;C·斯皮尔斯;F·冯;P·马尔姆斯特伦;M·费尔内;E·霍姆伯格;P·卡尔松 - PFS基因组学公司
- 2019-11-04 - 2021-12-03 - C12Q1/6809
- 公开了用于受试者中乳腺癌的诊断、预后和治疗的方法、系统和试剂盒。本发明还提供了生物标志物和临床上有用的基因组分类器,它们用于鉴定可能受益于辅助放射疗法的、处于低乳腺癌复发风险的受试者。在某些情况下,在本文中进一步公开了用于检测这样的生物标志物的探针集合,其用于确定受试者中的乳腺癌复发风险(例如,局部区域复发)。还提供了基于表达谱分析来确定乳腺癌复发风险以治疗乳腺癌的方法。
- 用于检测变体核苷酸的方法-201980086854.7
- T·S·拉马苏布拉曼尼亚;林赛·希尔-巴托斯基;M·马吉·奥梅亚拉;维多利亚·布鲁宁 - 卢米耐克斯公司
- 2019-12-19 - 2021-08-06 - C12Q1/6809
- 提供了用于确定在核酸分子中的目标位置处野生型或变体核苷酸的存在的方法和组合物。
- 用于定量人类肿瘤癌细胞中分子活性的方法-201980083888.0
- A·斯凯德波;U·戈沙达斯泰德 - 新加坡科技研究局
- 2019-10-18 - 2021-07-30 - C12Q1/6809
- 本文公开了基于多个表达谱集分别预测癌细胞和非癌细胞的表达谱的方法,其中多个表达谱集中的每一个均获得自包含一种肿瘤类型的癌细胞和非癌细胞混合物的肿瘤来源的样本。该方法包括:a.确定肿瘤来源的样本的肿瘤纯度值,b.提供表达谱集,其中表达谱集包含由肿瘤来源的样本所包含的癌细胞和非癌细胞表达的多种或全部分子的混合表达数据,以及c.通过将表达谱外推至至少基本上等于1或0的肿瘤纯度值,对每个混合表达数据进行去卷积,由此分别预测癌细胞和非癌细胞的表达谱。在一个实施方案中,使用共有方法,根据DNA、拷贝数以及mRNA表达数据,估计肿瘤纯度值。
- 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合症(ME/CFS)的生物标志物-201980066179.1
- 山村隆;佐藤和贵郎;小野纮彦;松谷隆治;中村征史;北浦一孝 - 国立研究开发法人国立精神·神经医疗研究中心;组库创世纪株式会社
- 2019-08-21 - 2021-05-25 - C12Q1/6809
- 本发明提供一种诊断肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合症(ME/CFS)的方法。本发明提供一种将B细胞受体(BCR)库作为肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合症(ME/CFS)的指标的方法。可以使用从由对象的BCR的IgGH链可变区中的1个以上的基因的使用频率、对象的BCR多样性指数、以及对象的1个以上的免疫细胞亚群的数量构成的组中选择的1个或多个变量作为对象的ME/CFS的指标。
- 抗体-药物缀合物的敏感性标志物-201980055378.2
- 冈嶌大祐;安田哲;榎本圭 - 第一三共株式会社
- 2019-08-22 - 2021-04-30 - C12Q1/6809
- 本发明提供了鉴定待给予含有抗hTROP2抗体的药物的受试者的方法,其中受试者是患有癌症的人患者,且其中该方法使用mRNA水平的基因表达量作为指标。本发明涉及用于鉴定待给予含有抗hTROP2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人类患者,所述方法包括:从诊断为患有癌症的人类患者获得生物样品;评价所述生物样品中hTROP2基因在mRNA水平的表达量;评价所述生物样品中的SLFN11基因在mRNA水平的表达量,其中所述生物样品是确定具有hTROP2基因的高表达量的生物样品;以及将提供所述生物样品的人类患者鉴定为要给予含有抗hTROP2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是确定具有SLFN11基因的高表达量的生物样品。或者,该方法包括:从诊断为患有癌症的人类患者获得生物样品;评价所述生物样品中hTROP2基因和SLFN11基因在mRNA水平的表达量;以及将提供所述生物样品的人类患者鉴定为要给予含有抗hTROP2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是确定具有hTROP2基因和SLFN11基因的高表达量的生物样品。
- 用于监测器官健康和疾病的方法和系统-202080003539.6
- 李勇 - ILLUMINA公司
- 2020-01-22 - 2021-02-26 - C12Q1/6809
- 本申请提供了用于监测组织和器官健康的方法、组合物和系统。本申请提供的方法、组合物和系统从无细胞DNA(cfDNA)样品中提取基因座特异性拷贝数信号,以鉴定组织特异性cfDNA拷贝数谱,并能够定量cfDNA样品中的组织部分。
- 基于微阵列的多重病原体分析及其应用-201980030521.2
- M·E·霍根;M·R·梅;F·H·埃格斯 - 帕瑟根迪艾斯有限公司
- 2019-03-08 - 2020-12-29 - C12Q1/6809
- 本文提供了用于DNA序列检测和分析的三维晶格微阵列系统及包括其组分的试剂盒。在该系统中,固体支持物具有多个双功能聚合物接头,每个接头具有顶端结构域和底部末端,可选地具有连接到底部末端的荧光标记,并且在多个双功能聚合物接头的顶端结构域上连接多个核酸探针。还提供了一种用于制造微阵列系统的方法和检测和识别植物样品中的病原体的方法或通过使用合成的DNA的已知拷贝数作为内部标准来确定未纯化的核酸样品中的病原体DNA的拷贝数的方法。
- 评价未分化细胞的状态的方法及其应用-201980010345.6
- 冈祐马;相原祐希 - 希森美康株式会社
- 2019-01-09 - 2020-09-11 - C12Q1/6809
- 本发明的课题在于,提供能够在不破坏细胞的情况下评价未分化细胞的状态的方法。通过提供一种评价未分化细胞的状态的方法来解决上述课题,所述评价未分化细胞的状态的方法包括:测定包含未分化细胞的液体的液相级分中的选自miR371、miR372和miR373中的至少1种miRNA的工序;和基于该miRNA的测定值评价该未分化细胞的状态的工序。
- 被测试样的评价方法-201980007441.5
- 斋藤香织;藤田郁尚;冈田文裕;石井健 - 株式会社漫丹;国立研究开发法人医药基盘·健康·营养研究所
- 2019-03-14 - 2020-08-28 - C12Q1/6809
- 本发明提供一种被测试样的评价方法,其是能够容易地评价被测试样是否具有抑制皮肤细胞中的细胞因子产生的作用的被测试样的评价方法,该评价方法基于由被测试样通过TRPM4表达细胞的TRPM4所引起的生理学现象,对被测试样所具有的细胞因子产生抑制作用进行评价。
- 用于通过使用磁场和设备进行高通量粒子处理的方法和系统-201980006204.7
- 扎迦利·阿普特;杰西卡·里奇曼;丹尼尔·阿尔莫纳西德;爱德华多·莫拉莱斯;康斯坦斯·诺里斯;尼古拉斯·奥登尼斯;帕梅拉·涅托 - 普梭梅根公司
- 2019-03-04 - 2020-07-28 - C12Q1/6809
- 该系统和/或方法的实施方式可以包括和/或应用磁性设备,该磁性设备用于促进磁场以从样品中分离核酸材料,该磁性设备包括支承组件,和磁性销集合,该磁性销集合附接至支承组件,且在附接至支承组件上时,磁性销集合在至少三个自由度上可移动,其中磁性销集合对样品容器的样品室的形状提供适应性。
- 使用双水相系统来分离、纯化和/或浓缩短链核酸片段的方法-201880071741.5
- 招彦焘 - 相达生物科技国际有限公司
- 2018-09-17 - 2020-06-30 - C12Q1/6809
- 本发明涉及使用双水相系统(ATPS)分离、浓缩和/或纯化具有约或少于250碱基对(bp)的短链核酸片段的方法。在一个实施例中,本发明提供了用于从含有核酸的生物材料中纯化具有约或少于250个碱基对的短链核酸片段的组合物和试剂盒。在另一个实施例中,本发明提供了某些盐和/或聚合物在双相系统中的用途,所述双相系统用于从含有核酸的生物材料中纯化具有约或少于250个碱基对的短链核酸片段。
- 用于序列数据标准化的新型内参寡核苷酸-201880012023.0
- M·D·诺丁 - 高尔门德尔分子植物生物学研究所有限公司
- 2018-01-29 - 2019-11-12 - C12Q1/6809
- 本发明涉及特别地用于小RNA序列数据标准化的新型内参寡核苷酸。本发明特别地提供各自包括单链核酸分子的至少两个子集的多个集,每个核酸分子包括:5′磷酸、至少3个随机核苷酸的序列、至少8个核心核苷酸的含有与靶序列相比的至少一个错配的核心序列、至少3个随机核苷酸的序列、以及3′修饰,其中每个子集包括具有相同核心核苷酸序列和不同随机核苷酸的多个核酸分子,并且其中每个子集的核酸分子的区别在于核心核苷酸序列的至少一个核苷酸,及含有所述集的文库的生成。本发明还涉及核苷酸测序中的参考值和用于确定样本中靶序列量的方法。
- 用于评估前列腺癌晚期临床终点的算法和方法-201880011757.7
- 吕睿皛;M·克拉格;N·张;T·曼达拉;P·菲博;H·J·劳伦斯 - 基美健有限公司
- 2018-02-12 - 2019-09-27 - C12Q1/6809
- 本公开文本涉及基于多基因表达的基因组前列腺得分TM(GPSTM)算法用于评估前列腺癌患者中的各种临床终点的用途,所述临床终点是例如临床复发(CR)、生化复发(BCR)、远处转移(Met)和前列腺癌死亡(PCD)的风险。在一些实施方案中,确定低和中等风险的前列腺癌患者的GPS结果,以帮助确定针对那些患者的治疗策略。
- 专利分类