[发明专利]一种基于迭代EM聚类的单细胞转录组疾病特异性细胞分析方法在审
申请号: | 202310083812.6 | 申请日: | 2023-02-08 |
公开(公告)号: | CN116486920A | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 黎勇;陈笑天;何谐;刘锐;吴金泽 | 申请(专利权)人: | 重庆大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B35/00;G16H50/30;G06F18/23213 |
代理公司: | 重庆大学专利中心 50201 | 代理人: | 黄涛 |
地址: | 400044 *** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | 本发明涉及单细胞转录组数据的分析方法技术领域,特别涉及一种基于迭代EM聚类的单细胞转录组疾病特异性细胞分析方法。主要包括以下步骤:首先利用图的聚类方法与细胞标志基因进行细胞分群。然后获取感兴趣的某一细胞群在疾病环境下的上调基因和下调基因。接下来使用打分算法对细胞进行打分并降维到分数空间。然后利用迭代EM聚类算法将所分析的细胞分为两群,随后将结果分类为疾病特异性细胞和对照组正常细胞。本发明提出一套适用于所有疾病条件下单细胞转录组数据集的研究方法,为该类型数据集的分析提供了新的模块化思路。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 em 单细胞 转录 疾病 特异性 细胞 分析 方法 | ||
【主权项】:
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